아실기의 운반체로 사용되는 조효소A(CoA)의 유도체 중 하나로 조효소A의 SH기에 아세트산이 티오에스터결합을 한 화합물이다. 아세틸조효소A의 합성법에는 ATP의 AMP와 피로인산으로 분해됨과 동시에 아세트산과 조효소A의 합성에 의해서와 아세틸인산에서 조효소A로 아세틸기 전이에 의해서, 피루브산에서 탈수소반응 등에 의해 합성될 수 있다. 아세틸조효소A가 관여하는 반응에는 아세틸콜린, 아세틸글루코사민 등의 합성에 이용되고 이산화탄소와의 결합으로 지방산 합성의 개시반응에 관여하고 환원에 의해 아세트알데히드가 생성되고 세균에 의한 알코올 발효의 중간체 등의 다양한 반응에 관여한다.