어느 한쪽의 어버이와 잡종 1대와의 교배로써 이루어진다. 이는 자손 1대의 유전자형을 밝히기 위해 행한다. 이때 교배를 이루는 어버이는 유전자형이 일치하거나 유사하다면, 교배 당시의 같은 개체가 아니어도 무방하다. 특히 어버이가 갖는 열성호모기질을 이용하여 유전자의 구성을 가리는 역교배를 검정교배라고 한다. 곤충이나 동물의 품종개량에 역교배가 이용되는데, 이를 탑 교배(top cross)라 한다. 잡종 1대인 우수한 암컷의 후손을 다시 부(父) 또는 부와 유사한 형질의 수컷과 교배하여 뛰어난 품종을 얻게 된다.