세포질내에 있으면서 유전형질 발현을 지배하는 인자. 염색체상에 있으면서 멘델식 유전을 하는 핵유전자에 대응하는 용어이다.

배(胚) 발생시 세포질의 대부분은 자성(雌性) 생식세포에 유래하므로 모계의 형질이 자손에게 전달된다.

그 예로 이끼류의 세포질 유전현상(플라스몬), 식물의 색소체(플라스토진), 짚신벌레의 카파 입자, 효모발효효소(시토진) 등을 들 수 있다.

세포질 유전자 중 색소체에 존재하는 것을 색소체 유전자, 미토콘드리아에 존재하는 것을 콘드리오진(chondriogene)이라고 한다.

미토콘드리아 · 엽록체 등의 세포소기관에서 염색체라고 부를 수 있는 DNA가 분리되기도 한다.