일반적으로 식물이나 동물에서 유래한 독성물질을 말한다. 이 독소는 단백질에 비롯한 고분자 물질이 체내에 들어와 유독성을 가지는 물질을 뜻한다. 기생생물체 중에도 주로 병원성 세균 등에 의해서 만들어진 유독물질이나 부패한 유기물에서 생긴 유독화합물도 독소에 포함된다.
생물체가 발생하는 독소에는 아주까리독, 아까시나무독 등의 식물성독소와 복어독, 뱀독과 같은 동물성독소로 나누어질 수 있고, 인체에 들어와 유해성을 가지는 물질은 균체내독소와 균체외독소로 구분할 수 있다.