우성 인자와 열성 인자의 우열관계가 명확하지 않아 우성과 열성의 유전 형질이 모두 나타나는 것을 불완전 우성이라고 하는데, 이 불완전 우성 유전자로 인하여 후손을 만들어 유전이 일어날 때 확신한 우성의 형태가 나타나지 않고 열성과 우성의 중간 형태가 나타나는 유전을 말한다. 분꽃의 형태가 유전되는 것이 대표적이며, 멘델의 유전법칙에 따른 형질의 분리가 제대로 이루어지지 않아 표현형이 열성과 우성의 중간 형태로 나타나게 된다.