혈액의 응고에 관계하는 프로테아제(단백분해효소)의 하나. 혈장(血體) 속에 전구체(前騙體) 프로트롬빈으로서 존재하며, 혈관의 손상, 출혈시에 활성화되어 트롬빈이 된다.

사람의 트롬빈은 분자량이 3만 5,000이다.

혈액 속의 가용성피브리노겐을 가수분해하여 불용성(不溶性)인 피브린으로 변화시키는 반응을 촉매함으로써 혈액을 응고시킨다.

피브리노겐에 대한 기질특이성(氣質特異性)은 매우 높으며, 피브리노겐 분자의 6개의 기본구성단위 중 2개의 a사슬, 2개의 사슬의 N 말단쪽에 있는 아르기닌과 글리신 사이의 4군데의 펩티드결합만을 가수분해한다.

트롬빈은 칼슘 존재하에 제 XⅢ인자라 불리는 표로트랜스글루타미나아제를 활성화하고, 활성제 XⅢ인자는 피브린의 단위체를 교차결합(交又結合)시켜 응고시킨다.