같은 유전자 자리에 있으면서 형질발현 작용이 조금씩 다른 한 무리의 유전자. 즉 한 조의 대립하는 형질에 세 개 또는 그 이상의 유전자가 관계하고 있는 경우 각 유전자를 말한다.

초파리에서는 흰색눈을 나타내는 유전자는 붉은색을 나타내는 유전자에 대해 대립 유전자이며 열성이다.

그 외에 같은 유전자 자리에 있는 에오신 유전자는 흰색에 대해 우성이고 붉은색에 대해 열성이다.

이 유전자 자리에는 빛깔을 나타내는 유전자가 흰색과 붉은색 외에 담갈색 · 아이보리 · 담황색 · 살구색 · 에오신 · 버찌색 · 피색 · 산호색 · 포도주색 등이 있으며 이들 모두는 복대립유전자이고 서로의 관계는 진한 색이 열은 색에 대해 우성이다.

또 이 모든 유전자는 흰색에 대해 우성이며 붉은색에 대해 열성이다.

사람에 있어 혈액형도 A, B, O 세 유전자가 복대립유전자로 되어 유전한다.

이들 유전자 사이의 우열관계는 A와 B는 O에 대해서 우성이고 A와 B 사이에는 우열관계가 없다.

따라서 혈액형 O형의 유전자형에서는 OO형, AB형은 AB형 각 한 종류 뿐이나, A형과 B형은 각기 AO와 AA, BO와 BB 두 가지씩이다.