현미경 관찰용 시료(試料)를 절편(切片)으로 만드는 기기. 특히 생체 조직이나 세포에 많이 이용된다.
광학현미경용으로는 회전식과 활주식이 있으며 2~3μ에서 수십μ의 두께로 자른다.
전자현미경용으로는 더욱 얇은 절편이 필요해 0.1μ 이하의 초박절편을 만드는 울트라마이크로톰이 사용되며 유리칼이나 다이아몬트칼을 사용하여 자른다.
기계활주형식과 열팽창형식이 있으며 마이크로톰에 이용되는 시료는 고정·동결에 의하거나 파라핀과 같은 매몰제에 넣어 굳혀서 사용한다.