대립형질(對立形質)에 대응하는 한 쌍의 유전자. 대립인자라고도 한다.

상동염색체(相同染色體)가 서로 대응하는 부위인 상동의 유전자 자리를 차지한다.

대립유전자는 기호화하여 표시하며 우성은 알파벳의 대문자로, 열성은 소문자로 표시한다.

예를 들면 완두콩의 황색은 녹색에 대해 우성인데, 황색은 Y로 녹색은 y로 표시한다.

때로는 우성유전자를 +로 표시하기도 한다.

즉 대립유전자Y와 y를 가진 개체 Yy를 표시하는 방법은 이외에도 +y/y, +/y가 있다.

복(複)대립형질에도 그에 상응하는 유전자군(群)인 복대립유전자가 존재한다.