기생(寄生) 또는 공생(共生)관계인 균류와 긴밀하게 협력하며 수분 및 영양을 공급하는 고등식물의 뿌리. 외생균근(外生菌根)과 내생균근(內生菌根)으로 대별된다.

외생균근의 균사는 뿌리조직의 세포 틈으로 들어가지만 세포 안으로는 들어가지 않는다.

내생균근의 균사는 뿌리의 표피조직세포 안으로 침입한다.

균류는 뿌리에서 탄수화물을 공급받지만 유기질소 화합물을 분해 흡수함으로써 식물체를 돕는다.

수목, 특히 소나무·너도밤나무·자작나무·버드나무과(科) 등에 많다.

이들은 균근을 만드는 균류에는 송이버섯목(目)의 무더기버섯·뎅그버섯·풍선버섯·연지버섯·그물버섯 등의 버섯류에 많다.

나무는 녹색식물이기 때문에 균의 도움없이도 살아갈 수는 있으나 토양 속에 질소·인산 등의 비료가 모자랄 때에는 균근균과 공생하는 편이 훨씬 생육이 좋다.