핵산의 분해에 관여하는 모든 가수분해효소의 총칭. RNA에 특이적으로 작용하는 것을 리보뉴클레아제(RNase), DNA에 특이적으로 작용하는 것을 디옥시리보뉴클레아제(DNase)라고 한다. 분해양식에서는 엔도뉴클레아제와 엑소뉴클레아제로 나누며, 분해산물에는 5  미만의 인산기를 가진 뉴클레오티드를 생성하는 것(5 -P생성효소)과 3 미만의 인산기를 가진 뉴클레오티드를 생성하는 것(3 -P생성효소)으로 나뉜다. 주로 2중 사슬의 DNA나 RNA에 작용하는 효소(DNase I , DNase II , ATP의존성 DNase, RNase Ⅲ 등), 한겹사슬의 DNA나 RNA에 작용하는 효소(뉴클레아제 S1〈또는 S 〉, 뉴클레아제 P1〈또는 P 〉, 엑소 DNase I , RNase II 등), 특정 염기를 인식하여 분해하는 염기특이적 효소(RNase , RNase U , RNase A, T4-엔토뉴클레아제 Ⅳ 등), 핵산의 고차구조를 인식하는 효소(RNase H, RNase P) 등이 포함된다. RNA의 프로세싱 효소, mRNA의 인트론을 제거하는 효소(스플라이싱 효소)등의 존재가 알려져 있다.