여러 개의 아미노산이 펩티드 결합에 의해 연결된 화합물을 말한다. 보통 결합한 아미노산 잔기의 수가 10개 이하이면 올리고펩티드라고 그 이상일 경우를 폴리펩티드라 한다. 폴리펩티드는 독자의 입체구조를 띠고 있으며 호르몬, 효소, 항체 등의 중요한 생리 활성화 작용을 한다. 또한 아미노산의 종류와 결합수, 또는 배열에 따라 화학적, 물리적 성질과 기능 등이 다양하다. α-아미노산을 비롯하여, β-아미노산, γ-아미노산 등으로 분류하며 천연펩티드도 존재한다. 또한 한 종류의 아미노산이 여러 개 중복되어 결합한 경우를 폴리아미노산이라고 하는데, 대표적으로 글루타민산이 여러 개 결합한 폴리글루타민산이 좋은 예이다.